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blastp使用教程

时间:2026-10-26 05:32:14来源:

BLASTP是用于蛋白质序列比对的常用工具,适用于查找相似蛋白序列。以下是其基本使用方法和参数说明。

参数 说明
-query 输入蛋白质序列文件
-db 指定数据库名称(如nr)
-out 输出结果文件名
-evalue 设置期望值阈值(默认10)
-num_alignments 返回的匹配数(默认50)
-outfmt 输出格式(如“6”为简明格式)

使用命令:`blastp -query seq.fasta -db nr -out result.txt -evalue 1e-5 -num_alignments 10 -outfmt 6`

建议根据需求调整参数,确保结果准确且高效。

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